DEPARTEMENT MICROSCOPIE
Responsable : Philippe Roingeard
Plateforme IBiSA de Microscopie Electronique de l’Université de Tours.
Le Département des Microscopies est un plateau technique mutualisant les appareils et les compétences d’imagerie microscopique au service des équipes de l’Université de Tours, des grands organismes extérieurs à l’Université et du secteur privé industriel.
Ce département est associé à plusieurs structures fédératives : PST Analyse des Systèmes Biologiques, Groupement de Moyens Scientifiques et Techniques de Tours (GMSTT), FED 4225 (ancien IFR 136) et FED 4226 (ancien IFR 135). Il est membre du Réseau d’Imagerie en Microscopie Electronique (RIME, anciennement RCCM).
La plate-forme a été labellisée IBiSA (Infrastructures en Biologie Santé et Agronomie) en 2015.
Prestations internes
Elles constituent un support logistique indispensable aux deux FED de l’Université (FED 4225 « Agents Infectieux, Immunité et Thérapies » et FED 4226 « Neuroimagerie Fonctionnelle: de l’image à la fonction ») ainsi qu’aux autres équipes de l’axe Sciences de la Vie et de la Santé et de l’axe Sciences et Technologies.
Les prestations peuvent aller de la seule mise à disposition de façon autonome des appareils lourds, jusqu’à la prise en charge complète d’une problématique de recherche spécifique par le personnel encadrant du plateau technique.
Le coût des travaux effectués pour les équipes de Tours est à leur charge selon une tarification propre disponible à leur demande.
Prestations externes
La reconnaissance à l’échelon national et international de la qualité des compétences de ce plateau technique, contribue à développer une politique d’ouverture et de valorisation de l’Université de Tours vers un partenariat public ou privé.
Des collaborations sont établies avec de grands organismes publics extérieurs à l’Université (Institut Pasteur, Museum d’Histoire Naturelle de Paris, équipes INSERM, Necker, St Louis…)
Des prestations de haut niveau sont développées avec le secteur privé industriel national et international, dans tous les domaines d’exploration microscopique.
Ces prestations sont facturées selon un devis établi après étude des projets scientifiques et/ou protocoles techniques et concertation entre les partenaires.
Charte de la Plate-Forme
Définition
Une plate-forme est le regroupement sur un même site des équipements et des moyens humains destinés à offrir à une communauté d’utilisateurs des ressources technologiques de haut niveau. En adoptant la présente charte, la plate-forme s’engage à une ouverture large au niveau régional et national, non seulement aux équipes du site, mais aussi aux expérimentateurs extérieurs, quel que soit leur rattachement (organismes publics, entreprises…). La reconnaissance d’une plate-forme et les moyens spécifiques (financement, personnel) qui en découlent sont conditionnés par un cahier des charges général, qui pourra être précisé selon la thématique de la plate-forme.
Ouverture
La plate-forme devant être ouverte aux équipes extérieures au site, les locaux qui lui sont affectés doivent présenter une superficie suffisante pour accueillir les équipes utilisatrices. Cette ouverture impose des effectifs dédiés à la plate-forme qui ont la capacité de répondre à la demande de service et d’encadrement.
Mode de gestion
Le fonctionnement et l’animation de la plate-forme sont sous la responsabilité d’une personne bien identifiée. La plate-forme se dote d’un conseil scientifique, comportant des utilisateurs et des experts extérieurs, qui définit les priorités des projets, s’assure de la qualité des prestations offertes et propose les évolutions méthodologiques. La plate-forme affiche de manière formalisée l’offre de service, les conditions d’accès et les tarifs.
Pour le fonctionnement de la plate-forme, le GIS IBiSA conseille la mise en place d’un management de la qualité inspiré par la norme ISO 9001. Si une démarche de certification ISO 9001 peut être une aide à l’optimisation des activités des PF voire à leur valorisation, elle ne peut en aucun cas constituer un critère d’évaluation scientifique et technologique pour obtenir la labellisation IBiSA.
Evolution technologique
La plate-forme doit assurer la pérennité de sa performance technologique par une veille technologique active et un plan d’action pour la mise à niveau des matériels et la formation des personnels. Cet objectif est d’autant mieux atteint que la plate-forme soutient des recherches à caractère méthodologique aboutissant à des publications scientifiques ou à des actions de valorisation (dépôt de brevet, création de jeunes pousses…).
Formation
Les ressources humaines et matérielles disponibles sur la plate-forme sont mises à profit pour la formation d’étudiants (stagiaires, doctorants…), d’ingénieurs et techniciens et pour des programmes d’animation et de formation scientifiques et techniques (séminaires, ateliers, sessions d’études…).
Evaluation
Le respect des directives énoncées dans le cahier des charges doit être évalué pour chaque plate-forme par une instance mandatée par les organismes ayant procédé à l’affectation des moyens spécifiques. Le degré d’ouverture de la plate-forme aux équipes extérieures est un critère majeur d’évaluation. Cette évaluation a posteriori sera effectuée périodiquement et conditionnera la poursuite du financement ou le maintien du personnel dédié.
(Charte des Plateformes IBiSA)
- Analyse en MET de cellules et tissus et immunomicroscopie électronique
- Analyse en MET et MEB de particules (bactéries, virus, ADN, liposomes, macromolécules)
- État de surface, analyse élémentaire et cartographie spectrale par MEB et sonde EDS
- Reconstruction 3D à partir de coupes sériées en MET
- Localisation d’éléments cellulaires marqués (protéines virales, facteurs de signalisation…) par microscopie confocale à balayage laser
- Reconstruction 3D des volumes et quantification de la colocalisation de marqueurs à partir d’acquisitions en microscopie confocale
- Acquisitions confocales en time-lapse sur cellules vivantes
Microscope Electronique à Transmission JEOL JEM-1400 Plus (120 kV)
HT max. : 120kV ; MAG : à partir de x50 ; résolution : 0,2 nm-lignes
Porte-objet cryo Fischione (Model 2550)
Module STEM, détecteur BF/DF
Détecteur EDS Oxford 65 mm2 ; logiciel d’analyse AZtec
Camera CMOS GATAN OneView (16 MPx, en bas de colonne)
tomographie électronique, analyse d’image GATAN Latitude
Financement Etat/Région Centre-Val de Loire/IBiSA
Microscope Electronique à Transmission JEOL JEM-1011 (100 kV)
HT max. : 100kV ; MAG : à partir de x50 ; résolution : 0,2 nm-lignes
Camera CMOS GATAN Rio 9 (9 MPx, port grand angle)
Financement CHRU Tours
Microscope Electronique à Balayage à Effet de Champ Zeiss ULTRA Plus
Sonde d’analyse EDS (détecteur SDD) et logiciels SAMx : analyse élémentaire, quantification, cartographie spectrale
Système de cryopréparation/cryotransfert GATAN ALTO 2500
Financement Région Centre et FEDER
Equipements de préparation des échantillons
- Ultramicrotomes LEICA Ultracut UCT et UC7
- Cryo-Ultramicrotome LEICA EM UC7/FC7
- Système de congélation haute pression (HPF) LEICA ICE
- Appareil de cryo-substitution LEICA EM AFS2
- Automate de vitrification (cryo-plunge) THERMO Vitrobot
- Appareil à pulvérisation cathodique JEOL JUC-5000
- Métalliseur GATAN Precision Etching Coating System (PECS)
- Evaporateur SPI VacuPrep II
- Station d’effluvage (glow discharge) CORDOUAN Elmo
Microscopie Photonique
Microscope Confocal à Balayage Laser Haute Résolution
LEICA SP8 gSTED
- Objectifs :
- 10x (NA=0.30) HC PL Fluotar
- 20x (NA=0.75 HC PL APO
- 40x (NA=1.30) HC PL APO OIL
- 63x (NA=1.40) HC PL APO OIL
- 100x (NA=1.40) HC PL APO OIL STED WHITE
- Sources laser :
- WLL (« laser blanc », jusqu’à 8 longueurs d’ondes accordables entre 470 et 670 nm)
- UV 405 nm
- Ar 488, 514 nm (+ 458, 476, 496 nm)
- 4 Détecteurs : 2 PMT, 2 HyD (hybrides, haute sensibilité)
- Module FRAP
- Module FLIM LEICA FALCON
- Système super-résolution « gated-STED » (2D), laser de déplétion : 660 nm
- Platine motorisée XYZ
- Enceinte thermostatée/régulation CO2 (acquisitions sur cellules vivantes)
- Station de traitement d’images LEICA LAS-X v2.0 ; logiciel de déconvolution SVI Huygens.
Financement Etat/Région Centre-Val de Loire/INSERM
- un responsable administratif et scientifique : Philippe ROINGEARD (PU-PH)
- une secrétaire-gestionnaire : Isabelle SAUSSEREAU
- 2 ingénieurs de recherche : Pierre-Ivan RAYNAL et Rustem UZBEKOV
- 1 ingénieur d’études : Julien BURLAUD-GAILLARD
- 2 techniciennes : Juliette ROUSSEAU et Emma PERDRIAU
Cette unité composée de 6 personnes est dirigée par le Pr Philippe ROINGEARD et développe deux types d’activités, dont l’une est utilisatrice du département des Microscopies :
- une activité de Pathologie Ultra-Structurale : Emmanuelle BLANCHARD-LAUMONNIER (PU-PH) et Sébastien EYMIEUX (PHU)
- une activité de Biologie Moléculaire : Philippe ROINGEARD (PU-PH) et Christophe HOURIOUX (PU-PH)
Composition de l’équipe :
- Responsable administratif et scientifique, PU-PH : Philippe ROINGEARD
- Secrétaire-gestionnaire : Isabelle SAUSSEREAU
- Responsable technique, Ingénieur de Recherche : Pierre-Ivan RAYNAL
- Ingénieur de Recherche : Rustem UZBEKOV
- Ingénieur d’Etudes : Julien BURLAUD-GAILLARD
- Techniciennes : Juliette ROUSSEAU et Emma PERDRIAU
- Unité Fonctionnelle de Biologie Cellulaire :
- Pathologie Ultra-structurale
PU-PH : Emmanuelle BLANCHARD-LAUMONNIER
PHU : Sébastien EYMIEUX
Technicienne : Florentine CHESNEL - Biologie Moléculaire
PU-PH : Christophe HOURIOUX
Technicienne : Marie-Paule REGNER
- Pathologie Ultra-structurale
Répartitions des secteurs d’activité
- Secteur académique local : 39 %
- Secteur académique extérieur : 27 %
- Secteur privé : 34 %
Publications
(période 2016–2020)
Les noms des membres du Département des Microscopies sont soulignés.
Réservation microscope confocal
Pour pouvoir réserver :
- Rendez vous sur G.R.R (Gestion et Réservations de Ressources) en cliquant sur le lien : Aller sur G.R.R.
- Choisissez un horaire de libre.
- Ensuite contactez Madamme SAUSSEREAU Isabelle par téléphone (02.34.37.96.92) ou par e-mail pour confirmer votre réservation.